２００３年６月底，是中国航天员选拔首飞梯队的开始，全体航天员要进行结业考试。黄伟芬说：“航天员结业考试总共考了四次，而每次结业考试的成绩是要划入总成绩的。”７月３日，中国载人航天工程航天员系统评审委员会评定：１４名航天员全部具备了独立执行载人航天飞行任务的能力，予以结业，并授予了中国人民解放军三级航天员资格。这意味着中国第一代航天员队伍的正式诞生。
　　 黄伟芬说：“回顾这五年，我们觉得非常艰难。因为我们对１４名航天员的训练和制造飞船是同步做的，我们是一边建学校，一边要把学生培养出来。航天员训练要保证与整个工程同步进行。在针对航天器训练时，难题在于飞船的技术状态没有确定，无法很确定对航天员讲，所以训练大纲和细则都必须跟着调整。到强化训练阶段，大部分东西都定型了，也就好办了。”黄伟芬说：“性格是反映心理素质的一个方面，性格特点也是我们做测评的一个考察点。比如是否敏感，是否容易受外界影响，如果易受影响，说明你的情绪稳定性不是很好，杨利伟就属于那种不受干扰型。”在强化训练中，有一个“数管失效”的应急程序，指飞船进入太空后计算机管理程序失效，就要立刻改为手动操作应急返回。有报道说，这个程序一共有３０多道指令、５０多个动作，杨利伟能够做得分毫不差。
　　 “他确实是一个非常认真的人，很多人都关心这次他在飞船上看的是什么书，他看的是我们编写的《航天员正常飞行手册》。其实，我们说他能对手册倒背如流并不过分，但是我们也对他说过，如果休息时可以看一看手册。为了确保万无一失，不能完全靠记忆，他是在复习，绝没有做秀的意思。”
　　
　　 刻苦认真是我们对首飞梯队三个人强调的共同要求。黄伟芬说：“最终我们选择杨利伟，是因为他训练更全面、技术更到位。强化训练阶段最后又进行了十次左右的训练，每次完了都打分，最后相加以总分数来计算。从１４个人中选５人是有一个排序的，从５人中选３人又有一个排序。特别是在“９２１”初进行的第二轮遴选中，对５人又进行了认真地分析比较，经过评委的不记名投票选出３人作为中国首次载人航天梯队，他们是：杨利伟、翟志刚、聂海胜。”
　　 中国载人航天工程副总指挥胡世祥说：“在五个人中再优中选优，到最后一个月的时候，进入飞船模拟器里考，飞船模拟器就一个，操作也是他们训练了多少遍的了，怎么拉开档次？就是想设定一些陷阱。”黄伟芬解释说，“按正常程序，进舱后有一个对初始状态的检查，我们故意把状态设计错，就看你能不能发现，发现后怎么办。虽然大家训练都一样，但是面对这个表现还是不一样。”
　　 飞行程序和任务训练是最为重要的训练。在航天员训练中，利用飞行训练模拟器、飞船运动人工控制模拟试验系统等设备，进行正常飞行、应急飞行、飞行过程中各类故障的判断和处理等内容的训练要反复进行，才能做到在真正执行航天飞行任务时“万无一失”。黄伟芬说：“杨利伟每次都能打到９９分，连我们一些总师都不相信，分数怎么这么高？实际上我是很严格的，包括说话说错一次、漏说一次我都要扣分，操作程序的规定，他们有一点做得不规范我都要扣分，而杨利伟是始终排在第一位。”
　　 “程序”几乎成为杨利伟每训必提的词汇。他说：“我在训练中从没有想紧张的问题。在整个训练过程中，我一直在想着怎样按程序操作。”在某种程序上，杨利伟的整个表现已经如同机器人一样准确得没有破绽，这也使很多人怀疑他就是如此死板。
　　 作为第一个中国载人飞船的航天员，他的一举一动都有标志意义。黄伟芬说：“飞船远行期间，我们能看到他在飞船上的画面时，都是他在测控区内有重要的操作。航天员的操作非常多，有２００多项，有些是需要手控指令补发的，所以你能看到他的时候都是他有任务在身，要与地面交流的。我们原来也有很多设想，让他在太空有一些自选动作，甚至带上去一些小东西，但是最后都取消了。这毕竟是第一次，确保成功是最重要的，谁也不知道会发生什么事。实践证明，中国载人航天工程指挥部的决策是正确的，选杨利伟首次飞上太空也是对的。”